Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfx1P48377 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms