Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11bP46638 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms