Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept1P42209 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sept1P42209 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept1P42209 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept1P42209 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sept1P42209 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept1P42209 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sept1P42209 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sept1P42209 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept1P42209 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sept1P42209 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sept1P42209 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sept1P42209 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sept1P42209 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms