Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa4P31532 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa4P31532 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms