Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GrnP28798 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GrnP28798 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GrnP28798 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GrnP28798 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GrnP28798 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GrnP28798 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GrnP28798 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GrnP28798 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GrnP28798 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GrnP28798 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GrnP28798 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GrnP28798 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GrnP28798 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GrnP28798 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GrnP28798 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GrnP28798 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GrnP28798 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GrnP28798 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GrnP28798 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GrnP28798 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GrnP28798 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GrnP28798 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GrnP28798 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GrnP28798 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GrnP28798 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GrnP28798 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GrnP28798 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GrnP28798 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GrnP28798 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GrnP28798 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GrnP28798 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GrnP28798 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GrnP28798 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GrnP28798 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GrnP28798 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GrnP28798 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GrnP28798 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GrnP28798 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GrnP28798 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GrnP28798 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GrnP28798 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GrnP28798 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GrnP28798 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GrnP28798 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GrnP28798 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GrnP28798 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GrnP28798 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GrnP28798 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GrnP28798 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GrnP28798 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GrnP28798 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GrnP28798 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GrnP28798 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GrnP28798 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GrnP28798 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GrnP28798 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms