Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms