Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb8P28063 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms