Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka1P18653 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka1P18653 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms