Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rag1P15919 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rag1P15919 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rag1P15919 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rag1P15919 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rag1P15919 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rag1P15919 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rag1P15919 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms