Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spp1P10923 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spp1P10923 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spp1P10923 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spp1P10923 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spp1P10923 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spp1P10923 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spp1P10923 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spp1P10923 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spp1P10923 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spp1P10923 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spp1P10923 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spp1P10923 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms