Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XlrP05531 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XlrP05531 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XlrP05531 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XlrP05531 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XlrP05531 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XlrP05531 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XlrP05531 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XlrP05531 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XlrP05531 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XlrP05531 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XlrP05531 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XlrP05531 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XlrP05531 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XlrP05531 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XlrP05531 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XlrP05531 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XlrP05531 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XlrP05531 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XlrP05531 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XlrP05531 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XlrP05531 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XlrP05531 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XlrP05531 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XlrP05531 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XlrP05531 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XlrP05531 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XlrP05531 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XlrP05531 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XlrP05531 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XlrP05531 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XlrP05531 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XlrP05531 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XlrP05531 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XlrP05531 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XlrP05531 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XlrP05531 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XlrP05531 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XlrP05531 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XlrP05531 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XlrP05531 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XlrP05531 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XlrP05531 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XlrP05531 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XlrP05531 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XlrP05531 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms