Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Eb1P04230 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.3 ms