Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa7P02830 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa7P02830 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms