Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igk-V19-17P01633 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Igk-V19-17P01633 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Igk-V19-17P01633 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms