Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtatp6P00848 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms