Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB11O95342 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB11O95342 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB11O95342 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCB11O95342 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCB11O95342 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB11O95342 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB11O95342 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms