Protein–RNA interactions for Protein: O88712

Ctbp1, C-terminal-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp1O88712 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctbp1O88712 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp1O88712 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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