Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Foxq1O70220 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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