Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3cdO35904 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms