Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkcshO08795 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcshO08795 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrkcshO08795 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms