Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3aO08665 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3aO08665 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3aO08665 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3aO08665 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3aO08665 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3aO08665 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3aO08665 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3aO08665 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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