Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8298J3QPI0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm8298J3QPI0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms