Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AK157302I3ITR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AK157302I3ITR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AK157302I3ITR1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms