Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Farp1F8VPU2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Farp1F8VPU2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Farp1F8VPU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Farp1F8VPU2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Farp1F8VPU2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Farp1F8VPU2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp1F8VPU2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Farp1F8VPU2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Farp1F8VPU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms