Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptbn5F6UCX4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sptbn5F6UCX4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms