Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc171E9Q1U1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc171E9Q1U1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
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