Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc17E9PVB5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc17E9PVB5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms