Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc11B2RXC1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms