Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc22a28B2RT89 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a28B2RT89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.6 ms