Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms