Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm12A2AJ77 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm12A2AJ77 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm12A2AJ77 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms