Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc112A0AUP1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc112A0AUP1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms