Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms