Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHPF2Q9P2E5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms