Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Echdc3Q9D7J9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Echdc3Q9D7J9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Echdc3Q9D7J9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Echdc3Q9D7J9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Echdc3Q9D7J9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms