Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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