Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q71RC1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q71RC1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q71RC1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms