Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSRP2Q16527 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms