Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB31Q13636 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB31Q13636 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms