Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCOF1Q13428 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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