Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms