Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms