Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms