Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UbbP0CG49 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms