Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDIL3O43854 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms