Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms