Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ6

Ndufb3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3, mousemouse

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Length 104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb3Q9CQZ6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndufb3Q9CQZ6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndufb3Q9CQZ6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndufb3Q9CQZ6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndufb3Q9CQZ6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb3Q9CQZ6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndufb3Q9CQZ6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndufb3Q9CQZ6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb3Q9CQZ6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms