Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms