Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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