Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms